为了科学防治病害，现在很多地区的植保部门采用孢子捕捉仪来完成水稻病害的监测和预警。
水稻稻瘟病是水稻种植过程中最易感染的水稻病害，在我国很多的地区，水稻稻瘟病发生后可造成不同程度减产，尤其穗颈瘟或节瘟发生早而重，可造成白穗以致绝产，这样就给水稻的生产造成了不小的损失。近年来，为了加强水稻稻瘟病的监测和预警，很多地区都是利用孢子捕捉仪来监测稻瘟病孢子量。
目前进行水稻稻瘟病防治的最有效的方式，就是利用孢子捕捉仪来做好稻田的监测预警工作，依据“带药侦查，发现一点，控制一片”的防控策略，对发现的病点和发病中心及其周围实施药剂封锁，控制其进一步扩展，力争将水稻稻瘟病危害控制在最低水平。
由此防控策略也可以看出，针对于水稻稻瘟病的防治，一般是采取提早准备、适时预防，按照“预防为主，综合防治”的植保方针，而其中预防是非常重要的。采用孢子捕捉仪来进行条锈病菌孢子的实时监测，可以及时掌握病情发展动态，对水稻稻瘟病进行全面监测和预警。